Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI19

Pdgfc, Platelet-derived growth factor C, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfcQ8CI19 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PdgfcQ8CI19 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfcQ8CI19 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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PdgfcQ8CI19 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PdgfcQ8CI19 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfcQ8CI19 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfcQ8CI19 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PdgfcQ8CI19 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PdgfcQ8CI19 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfcQ8CI19 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PdgfcQ8CI19 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PdgfcQ8CI19 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfcQ8CI19 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PdgfcQ8CI19 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfcQ8CI19 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfcQ8CI19 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfcQ8CI19 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfcQ8CI19 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfcQ8CI19 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PdgfcQ8CI19 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PdgfcQ8CI19 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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PdgfcQ8CI19 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfcQ8CI19 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PdgfcQ8CI19 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PdgfcQ8CI19 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfcQ8CI19 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfcQ8CI19 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PdgfcQ8CI19 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfcQ8CI19 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfcQ8CI19 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfcQ8CI19 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfcQ8CI19 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfcQ8CI19 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfcQ8CI19 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfcQ8CI19 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfcQ8CI19 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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PdgfcQ8CI19 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms