Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cc2d2aQ8CFW7 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms