Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms