Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rdh13Q8CEE7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms