Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

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Length 866 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc178Q8CDV0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc178Q8CDV0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc178Q8CDV0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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