Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Atg4aQ8C9S8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Atg4aQ8C9S8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Atg4aQ8C9S8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Atg4aQ8C9S8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Atg4aQ8C9S8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Atg4aQ8C9S8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Atg4aQ8C9S8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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Atg4aQ8C9S8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Atg4aQ8C9S8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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