Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp20Q8C6M1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp20Q8C6M1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp20Q8C6M1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp20Q8C6M1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp20Q8C6M1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp20Q8C6M1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp20Q8C6M1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp20Q8C6M1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp20Q8C6M1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp20Q8C6M1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp20Q8C6M1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp20Q8C6M1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp20Q8C6M1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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