Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Hdac7Q8C2B3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hdac7Q8C2B3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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Hdac7Q8C2B3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hdac7Q8C2B3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac7Q8C2B3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hdac7Q8C2B3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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