Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm17219-201ENSMUST00000168439 593 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Tdrkh-203ENSMUST00000196386 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Olfr979-201ENSMUST00000080835 1045 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Zfp983-201ENSMUST00000039726 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm42783-201ENSMUST00000197075 795 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm43743-201ENSMUST00000197898 697 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim35Q8C006 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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