Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp38Q8BW70 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp38Q8BW70 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp38Q8BW70 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp38Q8BW70 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp38Q8BW70 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp38Q8BW70 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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