Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms