Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Pggt1bQ8BUY9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Pggt1bQ8BUY9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Pggt1bQ8BUY9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Pggt1bQ8BUY9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Pggt1bQ8BUY9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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