Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms