Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms