Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Lrfn4Q80XU8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Lrfn4Q80XU8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Lrfn4Q80XU8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms