Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp8Q80U87 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp8Q80U87 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp8Q80U87 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp8Q80U87 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp8Q80U87 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp8Q80U87 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp8Q80U87 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp8Q80U87 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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