Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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