Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ckap2lQ7TS74 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms