Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Actn1Q7TPR4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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