Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrc2bQ7TPM1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrc2bQ7TPM1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms