Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms