Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ubfd1Q78JW9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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