Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Pdzrn3Q69ZS0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Pdzrn3Q69ZS0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Pdzrn3Q69ZS0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Pdzrn3Q69ZS0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Pdzrn3Q69ZS0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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Pdzrn3Q69ZS0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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