Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Pkp4Q68FH0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Pkp4Q68FH0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Pkp4Q68FH0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Pkp4Q68FH0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Pkp4Q68FH0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Pkp4Q68FH0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Pkp4Q68FH0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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