Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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