Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PtprdQ64487 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PtprdQ64487 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PtprdQ64487 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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PtprdQ64487 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PtprdQ64487 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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