Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppp1r1bQ60829 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms