Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms