Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms