Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Tsr1Q5SWD9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tsr1Q5SWD9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms