Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm6899Q3USS0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms