Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28047Q3US59 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms