Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Skap2Q3UND0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms