Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b2Q3UJB0 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms