Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Snx27Q3UHD6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx27Q3UHD6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx27Q3UHD6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx27Q3UHD6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx27Q3UHD6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx27Q3UHD6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx27Q3UHD6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx27Q3UHD6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx27Q3UHD6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx27Q3UHD6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx27Q3UHD6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx27Q3UHD6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx27Q3UHD6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx27Q3UHD6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx27Q3UHD6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx27Q3UHD6 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx27Q3UHD6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx27Q3UHD6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx27Q3UHD6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx27Q3UHD6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx27Q3UHD6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx27Q3UHD6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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