Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms