Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms