Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm43674-201ENSMUST00000196313 791 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 AC153974.1-202ENSMUST00000218700 678 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Fam117bQ3U3E2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 Cxcl2-201ENSMUST00000075433 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fam117bQ3U3E2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms