Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TraddQ3U0V2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TraddQ3U0V2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms