Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hace1Q3U0D9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hace1Q3U0D9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms