Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rufy4Q3TYX8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rufy4Q3TYX8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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