Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ctdnep1Q3TP92 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ctdnep1Q3TP92 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ctdnep1Q3TP92 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdnep1Q3TP92 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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