Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde12Q3TIU4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms