Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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RubcnlQ3TD16 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RubcnlQ3TD16 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RubcnlQ3TD16 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms