Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Hdgfl1Q2VPR5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Hdgfl1Q2VPR5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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