Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrna5Q2MKA5 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms