Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpusd3Q14AI6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms