Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rpusd2Q149F1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rpusd2Q149F1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpusd2Q149F1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms