Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VgfQ0VGU4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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VgfQ0VGU4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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VgfQ0VGU4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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VgfQ0VGU4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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VgfQ0VGU4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VgfQ0VGU4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms