Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
StumQ0VBF8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms